限制上廁所次數，屬於公司內部規範，勞基法未明確規定，但對於人格權的不當要求，勞工可以拒絕。
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勞基法第32條第1項：
雇主有使勞工在正常工作時間以外工作之必要者，雇主經工會同意，如事業單位無工會者，經勞資會議同意後，得將工作時間延長之。
雇主要讓勞工加班要先經工會同意，無工會者經勞資會議同意
而工會或勞資會議的同意，是制度上的同意
勞基法第42條：
勞工因健康或其他正當理由，不能接受正常工作時間以外之工作者，雇主不得強制其工作。
勞工有正當理由，可以拒絕加班
也就是制度上同意之後，雇主仍要徵得勞工個別同意，才能使勞工加班
當然，如果勞資會議同意，勞工在無正當理由的狀況下，應配合加班
若無加班無加班費是違法的
依勞基法第14條第1項第6款：
有下列情形之一者，勞工得不經預告終止契約：
六、雇主違反勞動契約或勞工法令，致有損害勞工權益之虞者。
勞工可不經預告終止契約，並請求資遣費
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勞基法規範的是勞動條件的最低標準
勞基法第35條：
勞工繼續工作四小時，至少應有三十分鐘之休息。但實行輪班制或其工作有連續性或緊急性者，雇主得在工作時間內，另行調配其休息時間。
可以看到條文規範的是「至少」30分鐘
目的是為了保護勞工，讓勞工在連續工作一段時間後，能有充分的休息。
因此只要雇主安排的休息時間不低於法令規定，就沒有違法的問題。
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勞工局處理勞資問題有兩條路線
一是申訴檢舉，勞工局經勞動檢查確認違法情節後，依法開罰
但這只限於行政裁罰，並不會釐清雇主要返還多少工資、加班費、資遣費
（勞工局是行政機關，不是司法機關）
如果要追討工資、資遣費或加班費等權益，要另外申請「勞資爭議調解」
同樣是向勞工局申請，兩條路線並不衝突
調解如果失敗，後續就是走法院訴訟追討
建議您可向公司當地主管機關申訴
申訴管道可參閱勞動部：可申訴之相關單位
https://www.mol.gov.tw/topic/3067/5990/5999/14489/
