答：
1.依勞動部對於變形工時制之原則規範以，2週變形工時不受行業別限制任何行業均可適用，4週變形工時適用醫療服務業，8週變形工時適用於製造業，其中以4週變形工時彈性最大。
2.貴企業行業兼具：食品工廠（製造業），直銷門市（商品零售業），獨立出來的餐廳（餐飲業），應請檢視營利事業登記證所屬之行業別，作為適用變形工時制度之依據。惟如登記業別為製造業，則所屬商品零售及餐飲性質之業務恐難適用四週變形工時，解決之道建議餐飲及零售分別獨立出來成立事業單位，以資因應。
3.另補充說明，2週變形則不受行業別限制，任何行業均可適用。
因為,貴公司本身有製造業的部份,且有門市及餐廳的部份,
基本就是以製造彈性較為有限,所以,就是八週變形工時或雙週變形工時,
因此, 無法適用四週變形工時來涵蓋製造業的部份。
若有多種不同營業項目，在行業別的認定上，要視公司主要經濟活動。
因此應了解食品工廠（製造業）、直銷門市（商品零售業）、與餐廳（餐飲業）
這三大項的營收或經濟活動哪一個佔比較多。
或參考公司勞保的行業別。
確認了行業別後，再依法進行程序(經工會同意，如事業單位無工會者，經勞資會議同意)，只要取得合法的變形工時程序，就可以在公司內一體適用。
故若只能採八週變形，就得一體適用八週變形，這時候如果餐廳或門市想適用四週變形，就無法使用了。
採用變形工時制度的兩個條件：
- 符合中央主管機關(勞動部)指定之行業
（曹新南老師已有整理，可參閱『曹新南專欄』例假日不能亂搬，你知道嗎？ ） - 要經工會同意，如事業單位無工會者，經勞資會議同意（勞基法第30條、第30-1條）
既然是看行業適用，就要看公司屬於哪個行業
可參考主計總處的行業分類查詢
至於公司有多種不同營業項目的行業認定，則要視公司主要經濟活動為何？
較簡易的辨別方式，可以查公司投保勞保的行業別
以同時有工廠、門市、餐廳的狀況來說
工廠的經濟活動規模通常較大，應該會被認定為製造業
因此只能採用八週變形工時，輔以各行業皆可適用的雙週變形工時
如果雙週變形工時不敷門市與餐廳部門使用
一般常見的做法，可能是將門市與餐廳另外成立子公司管理，則可單獨適用四週變形工時
