哈佛大學運用Google Cloud超級電腦 研究心臟病新療法
記者／竹二
近日哈佛大學的一項尖端醫療研究計畫獲得 Citadel Securities 與 Google Cloud 的贊助，這項研究採用 Google Cloud 超級電腦運算服務，來模擬心血管疾病新興療法在人體內的成效。
▲哈佛大學的一項尖端醫療研究計畫獲得Citadel Securities與Google Cloud的贊助 (Image by Drazen Zigic on Freepik)
磁性控制的人造細菌鞭毛，用數位分身模擬新療法
主導這個計畫的是哈佛大學工程與應用科學學院教授 Petros Koumoutsakos，他的主要研究為利用磁性控制的人造細菌鞭毛（Artificial Bacterial Flagella，ABF），用以攻擊與溶解人體血管系統中的血塊及腫瘤細胞，創造數位分身來模擬這項新療法的效果，必須要能夠準確呈現人體內血管的形狀、大小與排列，也要具備逼真的血液流動與結構的相互作用，並能主動控制 ABFs。
不過，Koumoutsakos提到，目前全球只有少數的超級電腦，才能夠提供運作如此複雜規模的模擬所需的運算能力，有了 Citadel Securities 與 Google Cloud 的支援，就可以利用公有雲資源來處理大規模且逼真的醫療應用模擬，藉由輕鬆造訪公開的雲端資源來縮短解決時間，提高測試能力，降低處理某些急迫問題的研究成本。
雲端運算有潛力，想變超級電腦還有挑戰
Google Cloud 高效能運算技術專家 Bill Magro 也表示，大眾已經意識到雲端在解決問題與科學工程運算上的潛力，可是要變更雲端運算基礎設施讓它更像超級電腦，還必須要改變軟體與網路，以及硬體設計。
據了解，哈佛團隊在初期測試中，使用 Google Cloud 的雲端資源已經可以達到專用超級電腦的 8 成運算效能，相關測試在 GPU 與 CPU 上部署 2 款不同的程式碼，用以進行高效能運算的最佳化，其中之一是入圍 2015 年超級電腦應用軟體設計獎 Gordon Bell Prize 決賽的先進程式碼，另一個則是用以執行粒子模擬的開源程式碼 LAMMPS。
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本文由 科技島 授權轉載，原文〈哈佛大學運用Google Cloud超級電腦 研究心臟病新療法〉
